Podczas pracy sterownik przetwarza informacje z czujników (położenie wału korbowego, przepustnica, masowy przepływ powietrza, temperatura, tlen (sonda lambda), detonacja, prędkość) oraz - w zależności od trybu pracy silnika - wydaje polecenia sterujące do wtryskiwaczy, modułu zapłonu, regulatora obrotów biegu jałowego, zaworu odpowietrzania kanistra, przekaźnika pompy paliwowej i wentylatorów chłodnicy.
Czas zapłonu jest obliczany przez sterownik w zależności od prędkości obrotowej wału korbowego, obciążenia silnika (masowy przepływ powietrza lub położenie przepustnicy), temperatura płynu chłodzącego i obecność detonacji.
Skład mieszanki jest regulowany przez czas trwania impulsu sterującego podawanego na dysze (im dłuższy impuls, tym większy dopływ paliwa). Istnieje możliwość dowozu paliwa «synchronicznie» (w zależności od położenia wału korbowego, przy czym dysze są włączane parami - dla 1-4 i 2-3 cylindrów) i «asynchronicznie» (wszystkie wtryskiwacze działają niezależnie od położenia wału korbowego). Ostatni tryb jest używany podczas uruchamiania silnika.
Jeśli podczas kręcenia wałem korbowym silnika rozrusznikiem przepustnica jest otwarta o więcej niż 75%, sterownik odbiera sytuację jako tryb czyszczenia cylindrów i nie wysyła impulsów do wtryskiwaczy, odcinając dopływ paliwa. Odbywa się to, jeśli istnieje podejrzenie, że mieszanka jest nadmiernie wzbogacona (silnik «zalane») i dlatego nie zapala się. Jeżeli podczas przedmuchu silnik zacznie pracować i jego obroty osiągną 400 min–1, sterownik włączy dopływ paliwa.
Podczas hamowania silnikiem sterownik zuboża mieszankę, aby zmniejszyć toksyczność spalin, aw niektórych trybach całkowicie odcina dopływ paliwa.
Dopływ paliwa jest również wyłączany po wyłączeniu zapłonu, co zapobiega samozapłonowi mieszanki w cylindrach silnika (diesel).
Gdy napięcie zasilania spada, sterownik zwiększa czas gromadzenia energii w cewkach zapłonowych (do niezawodnego zapłonu palnej mieszanki) i czas trwania impulsu wtrysku (aby zrekompensować wydłużenie czasu otwarcia dyszy). Wraz ze wzrostem napięcia zasilania zmniejsza się czas gromadzenia energii w cewkach zapłonowych oraz czas trwania impulsu podawanego na wtryskiwacze.
Lampka kontrolna systemu zarządzania silnikiem w zestawie wskaźników informuje kierowcę o usterkach, ale nie zabrania dalszego ruchu samochodu. Jeśli system działa, to po włączeniu zapłonu lampka zapala się, ale gaśnie natychmiast po uruchomieniu silnika. Jeśli świeci się, gdy silnik pracuje, oznacza to awarie w systemie zarządzania silnikiem, których kody warunkowe zapisuje sterownik w pamięci (Baran). Jeśli błąd zniknie później (na przykład przywrócono styk w obwodzie czujnika), lampka może zgasnąć; w takim przypadku kod usterki nie jest kasowany, lecz zapisywany w pamięci i można go odczytać za pomocą przyrządu diagnostycznego podłączonego do złącza diagnostycznego znajdującego się po lewej stronie pod tablicą rozdzielczą (blisko przekaźników i bezpieczników). Aby skasować kody z pamięci sterownika należy odłączyć akumulator na co najmniej 10 sekund (lub wybierz odpowiedni tryb w narzędziu diagnostycznym).
Awaria niektórych elementów układu wtryskowego (elektryczna pompa paliwowa i jej obwód, moduł zapłonowy, świece zapłonowe i przewody wysokiego napięcia) nie jest wykrywany przez sterownik i odpowiednio lampka kontrolna systemu zarządzania silnikiem nie świeci. Jednak podczas przerw w iskrzeniu jednostka sterująca może wydać nieprawidłowy kod sygnału sondy lambda.